“维特比vs.流行病!”第5讲,风险估计

| 2020年10月19日

Bhaskar Krishnamachari分享了如何使用洛杉矶县的真实数据来可视化不同社区的COVID风险,以说明这种方法。

(艺术/ SHUTIANYI李)

(艺术/ SHUTIANYI李)

今年秋天,继美国国家工程院(美国)行动呼吁为了让工程师们“众包并集体集思广益针对冠状病毒疾病(COVID-19)的工程解决方案”,南加州大学维特比分校提供了“维特比vs.流行病!”bob国际首页登录这是南加州大学维特比分校的新系列讲座,旨在全面提供以工bob国际首页登录程为中心的框架,以应对和理解COVID-19大流行。

在为期10周的免费课程中,学生们将接触到无数的主题,从通过定向进化估算风险和蛋白质工程,到计算机科学和电气工程学院在自动化人类安全技术、检测错误信息和数字接触追踪方面所做的贡献。一到两个小时的课程在周四下午6点举行。

10月9日,Ming Hsieh学院研究员、电子和计算机工程教授、南加州大学Viterbi信息物理系统和物联网中心主任Bhaskar Krishnamachari发表了题为“风险估计”的演讲。bob国际首页登录Krishnamachari讨论了如何从流行病中定义感染风险,以及如何估计和可视化不同社区随时间变化的风险。


对于那些错过的人,你能简单地总结一下你的演讲吗?

它介绍了我们在南加州大学维特比开发的新的COVID-19风险评分。bob国际首页登录该分数是根据每个社区的最新病例数据每天计算的,它向个人表明了他们在未来24小时内在其社区内被感染的可能性。它还可以以彩色编码的地图形式呈现,显示不同社区的风险水平。现场版本的风险评分以及基于此的洛杉矶县彩色地图可以在这里找到


为什么这项研究很重要?它将如何帮助对抗COVID?

我们相信这个风险评分更直观,可以帮助社区更好地理解风险。对于人们来说,我们的风险评分可能比关于病例数据或Rt(一些来源用于传达风险的时变再现数)等参数的一般统计数据更容易理解。我们表明,与其他措施相比,我们的指标描绘了更准确的感染风险。


你如何将你的研究与学术界或工业界的类似研究或想法进行比较?

我们不知道任何其他学术或行业团队提出了任何风险评分指标,以帮助个人确定他们在每个社区层面上的感染概率。这种贡献的创新性是这项工作收到的原因之一洛杉矶COVID-19计算挑战赛一等奖由洛杉矶市和GRMDS在今年早些时候组织。

我们在一定程度上是基于经典的SIR流行模型,该模型在学术界很有名。但我们专注于该模型的一个特定的时变版本,并采取措施确保我们从中提取的数据对普通人来说特别清晰和集中。


就你的工作而言,接下来的步骤和/或里程碑是什么?

我们正在将工作提交给同行评审,并有一些想法来改进我们的代码和建模。我们希望看到其他城市、县和国家采用这种模式,帮助向公民传达风险。


跟我们说说你的合作者吧。每个人都有什么独特的技能?在这项工作中,您是否与医生、临床医生或其他非工程师合作?

我们的团队包括博士生Mehrdad Kiamari,他为这个项目做了大量的数学建模和编码,以及高级研究助理Gowri Ramachandran博士和博士后研究人员Quynh Nguyn博士,他们为维护我们的数据存储库贡献了重要的想法、代码和工作。我们还与洛杉矶市数据团队的官员,首席数据官Jeanne Holm和副首席数据官Eva Pereira合作,从洛杉矶获得相关数据,用于我们的建模和开发工作。


你能分享一个大流行生活中的故事吗?它对你的工作和家庭有什么影响?你在做什么来保持理智?

这是一段充满挑战的时期,但我也很感激有机会优先考虑重要和有意义的事情。在这样的项目中工作,既及时又对他人有帮助,而且比以往任何时候都更有回报。当然,研究往往是这样一种合作的努力;我怀念在美丽的校园里与人相处的时光,怀念在实验室或教室里与学生互动的时光。我每天都练习冥想,我认为它让我保持理智和高效。


从研究的角度来看,你认为这种病毒或整个大流行最令人惊讶或最违反直觉的方面是什么?

传播过程的高方差或分散性真的引起了我的兴趣。很多人听到大多数感染病毒的人并没有将其传播出去时感到惊讶。事实上,一小部分感染者是大多数感染的罪魁祸首。我们仍然没有很好地处理如何建模和管理这样一个过程。


关于这场大流行,有哪些对您意义重大的至理名言?

这不是专门关于大流行的,但这是引用自T.H.怀特的《曾经和未来的国王》的一段话,我用它作为我演讲的序言。它不仅很好地适应了当前的气候,还向我们展示了在这样的时代,我们如何仍然可以做有意义的事情:

“悲伤的最好的事情,”梅林回答说,开始喘着气,“是学习一些东西。这是唯一永远不会失败的事情。你可能会变老,身体都在颤抖,你可能夜里躺在床上睡不着觉,听着你血管的紊乱,你可能会想念你唯一的爱,你可能会看到你周围的世界被邪恶的疯子摧毁,或者你知道你的荣誉被更卑鄙的人践踏。那么,只有一件事可以做——学习。了解为什么世界在摇摆,是什么在摇摆。这是心灵永远不会枯竭,永远不会疏远,永远不会被折磨,永远不会害怕或不信任,永远不会梦想后悔的唯一东西。学习是你唯一要做的事情。看看有多少东西要学。”


如果你只能从你的演讲中分享一张幻灯片,它会是什么,为什么?

这张幻灯片总结了演讲内容,并展示了我们用颜色标注的洛杉矶县风险地图(就像本周的情况一样)。

相关论文:使用时变sir模型进行COVID-19风险估计

2020年10月19日出版

最后更新于2021年4月8日

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